그누보드3를 이용해서 프레임 구조를 설정할려고 할때 다음의 1,2 조건을 만족시키면서 문제 1,2의 충돌을 피해가는 어떤 좋은 방법이 있을까요?

조건1. 그누보드는 루트디렉토리에 설치되어야 한다.
조건2. 프레임은 상단(탑메뉴), 왼쪽(서브메뉴), 오른쪽(메인페이지처리) 으로 구성해야한다.

문제1. 현재 그누보드는 index.php에서 그누보드를 사용하기 위한 환경설정을 해야한다.
문제2. 프레임을 나누기 위해서는 index.php 에서 프레임 설정을 해야 한다.


** 개인적으로 찾아본 방법은 예전 그누보드 3.20에서 패치되었던 그후 몇번째 패치에서인가 다시 없어진 다음 기능을 이용해서
>    - config.php 에 $cfg[index] 변수 추가로 인한 모든 프로그램과 스킨 수정
>        ./?doc= 과 같은 방식을 ./index.php?doc= 과 같은 방식으로 수정
>        Windows APM , IIS 사용자를 위함

위 문제1의 그누보드가 index.php를 사용하는것이 아니라 idx.php를 사용하도록 변경하는 방법으로
모든 소스 및 스킨에서 ./?doc= 으로 되어있는 부분을 $cfg[index]로 변경하고
config.php에서 $cfg[index] = "index.php"; 로 되어있는 부분을 $cfg[index] = "idx.php"; 바꿔서 사용하도록 하면 될것 같은데...
혹시 더 좋은 방법이나
이 방법의 문제점이나 개선점이 보인다면 한말씀 부탁드립니다.