첫 답변이지만.. 도움이 되셨으면 좋겠습니다.

basic 스킨을 예로 말씀드리겠습니다.

스킨폴더(skin/board/스킨폴더)에 보시면..

list.skin.php 있습니다.

196줄 부터 보시면..

    <div class="board_search">
        <form name="fsearch" method="get">
        <input type="hidden" name="bo_table" value="<?=$bo_table?>">
        <input type="hidden" name="sca"      value="<?=$sca?>">
        <select name="sfl">
            <option value="wr_subject">제목</option>
            <option value="wr_content">내용</option>
            <option value="wr_subject||wr_content">제목+내용</option>
            <option value="mb_id,1">회원아이디</option>
            <option value="mb_id,0">회원아이디(코)</option>
            <option value="wr_name,1">글쓴이</option>
            <option value="wr_name,0">글쓴이(코)</option>
        </select>
        <input name="stx" class="stx" maxlength="15" itemname="검색어" required value='<?=$stx?>'>
        <input type="image" src="<?=$board_skin_path?>/img/btn_search.gif" border='0' align="absmiddle">
        <input type="radio" name="sop" value="and">and
        <input type="radio" name="sop" value="or">or
        </form>
    </div>

이중 삭제를 원하시는걸 지우시면 되겠지요?

예를 들어 회원아이디를 지우신다면...
<option value="mb_id,1">회원아이디</option>
<option value="mb_id,0">회원아이디(코)</option>

삭제를...

주석처리를 하신다면...
 <!-- <option value="mb_id,1">회원아이디</option> -->
 <!-- <option value="mb_id,0">회원아이디(코)</option> -->

이렇게 하시면 되겠네요.

미흡하나마 도움이 되셨으면 좋겠습니다.