서브도메인은 완전히 다른 주소로 이해 하시면 될듯합니다
아파치 서버 세팅을 할때는

일반 도메인 일경우
www.abc.com
DOCUMENT_ROOT /home/abc/public_html

와 같이 세팅을 하고
서브 도메인일경우
sub.abc.com
DOCUMENT_ROOT /home/sub_abc/public_html

와 같이 세팅할수 있습니다 그러므로 다른 도메인이라고 생각해도 무방하죠
물론 서버 아이피도 다르게 할수 있구요 이건 DNS 에서 세팅을해야 합니다.

다만 서브 도메인은 정책상 같은사이트라는 인식을 주며 , 회원 디비 공유등을 할수 있게 합니다.

가령 naver.com 에서
지식인 kin.naver.com 도메인
맵서비스 map.naver.com 도메인은
각 다른 서버 또는 다른 작업 공간이죠..
어떤 2차 도메인은 asp or php or jsp or .net 등으로 프로그램을 할수 있습니다

서브도메인이라고 하더라도 같은 서버내에 홈페이지를 구축한다면 회원을 불러오는데 별
어려움이 없습니다.
제경우는 cafe24.com에서 호스팅을 받고 있는데  서브도메인을 만들더라도 같은 DB를 사용
하기 때문에 서브도메인을 사용하더라도 문제없이 사용하고 있습니다.

감사합니다..